1 Muestras
Se recoge piel heces, saliva, mucosidad y secreciones vaginales de individuos de diversos países, sexo y distintos estados de salud. Los científicos han acordado seguir pautas comunes.

2 Adn

Se extrae el ADN del genoma de las muestras, de forma que se obtenga material genético de todas las especies presentes en ellas. La nueva tecnología permite analizarlo directamente.

3 Biblioteca

Según la tecnología empleada, a veces el ADN obtenido se introduce en otras bacterias para crear lo que se conoce como una biblioteca metagenómica.

4 Análisis
Quiénes son. Se buscan secuencias determinadas del ADN que ayuden a clasificar las bacterias por tipos o especies.
Qué hacen. Otra forma de análisis que se centra más en identificar las funciones de los genes de la muestra, aunque no se sepa quién los lleva.